Các vùng sản xuất whisky Nhật nổi tiếng nhất gồm Yamazaki, Hakushu, Yoichi, Miyagikyo, Chichibu và Nagahama. Mỗi vùng sở hữu khí hậu, nguồn nước và phong cách chưng cất khác nhau, tạo nên sự đa dạng trong hương vị whisky Nhật. Điển hình như Yamazaki mang hương trái cây chín, Hakushu thanh mát thảo mộc, Yoichi đậm cá tính kiểu đảo lạnh và Chichibu giàu tính thủ công.